后各国缔结了休战条约，世界迎来了将近20年的和平发展期。
幼年失去双亲的大蛇丸在父母墓碑前祭拜的时候发现了白蛇蜕去的蛇皮，从此与白蛇结缘。经历过数次战争引发出对生命的思考后，大蛇丸决心探索世间一切真理，解开所有忍术的秘密，以实现自己追求生命真谛的目标。